Сегодня вставлял банеры и счетчики в WordPress.
Для этого в конец файла /wp-content/themes/default/footer.php перед строчками </body></html> следующие строки:
<?php if (file_exists(ABSPATH.'/extensions/LiveInternet.php'))
{readfile(ABSPATH.'/extensions/LiveInternet.php');}; ?>
<?php if (file_exists(ABSPATH.'/extensions/begun.php'))
{readfile(ABSPATH.'/extensions/begun.php');}; ?>
<?php if (file_exists(ABSPATH.'/extensions/analyticsTracking.php'))
{readfile(ABSPATH.'/extensions/analyticsTracking.php');}; ?>
<?php if (file_exists(ABSPATH.'/extensions/rambler.php"); '))
{readfile(ABSPATH.'/extensions/rambler.php"); ');}; ?>
И в корневой директории сайта создал папку extensions с файлами в которых коды соответствующих банеров и счетчиков.
Если требуется добавлять в правую панель WordPress, то вставляем аналогично, в подходящее место файла sidebar.php.