Установил ESXi, перезагрузился, не загружается, пропускает загрузку с HDD и пытается загрузится с сети.
Винчестер был после FreeBSD, подумал, что проблема связана с загрузчиком, отчистил винт полностью, переустановил… не помогло.
В итоге оказалось, надо было включить поддержку UEFI (по умолчанию была отключена).