Вирусы скрыли папки на флешке (например диск D:), откроем:
win+R запускаем cmd
в консоли выполняем переход в на диск D:
C:\Users\rrv>d:
И выполним
D:\>attrib -s -h /d /s
-s снимает атрибут системный
-h снимает атрибут скрытый
/d /s — для всех папок и файлов в текущей папке (в нашем случае диске D:)